负序电流在发电机定子绕组内将产生负序旋转磁场，该磁场将以两倍的旋转速度切割转子，从而在转子的励磁绕组、阻尼绕组及转子本体表面感应电流，这些电流将在上述部位引起损耗和发热，从而降低了运行效率，特别是在汽轮发电机整块转子表面上感应的电流将通过转子两端的护环形成回路流通，而护环和转子本体搭接处接触电阻较大，所以发热更为严重，常有这个部位被烧坏和事例发生。这些均为负序电流给发电机造成的损害。由负序电流产生100周的交变电磁转矩。该附加转矩同时作用在转子转轴和定子机座上，引起频率为每秒100次的振动，有可能损坏机座等结构。 若负序电压加在三相电动机上，将有负序电流流入电动机定子绕组，产生负序旋转磁场，这样电动机除有对应于正序电流的正序阻抗外，还有过应的负序电流、负序阻抗，从而使电动机损耗增加，温度上升。负序电流产生反向转矩，从而使电动机的电磁转矩、输出功率和效率大大降低。
 
　　由于电力系统不对称运行，其负序电流在发电机中产生的负序旋转磁场将在发电机定子绕组中产生一系列奇次谐波，在转子绕组中引起一系列的偶次谐波，使得电力系统中电流电压的谐波分量增加。另外，这些高次谐波电流在输电线路上流通，将会对输电线路附近平行的通信线路形成干扰。
 
　　负序电流还可能引起继电保护负序起动元件的频繁起动，进而可能造成继电保护的误动或损害。